События Assassin's Creed: Origins происходят в древнем Египте в 48 г. до н.э. Мы играем за меджая по имени Байек.
Он мстит за убийство своего сына Хему людям в масках. В этом ему помогает друг меджай по имени Хепзефа.
Байек на своей Родине в Сивах убивает двух людей в масках:Руджека(Цапля) и Медунамона (Ибиса).
После этого Байек решает направится к своему другу жрецу Менехету и помогает ему в делах храма. Байек отправляется в Александрию к своей жене Айе.
Здесь он встречается с драматургом Фаном, который отводит Байека к Айе. Она рассказывает как убила Ктесоса (Барана) и Актеона (Стервятника), и где можно найти Бегемота.Байек решает сначала убить приближенного человека к Бегемоту - Геннадия. После этого за Байеком начинают охотиться филаки.
Байек узнаёт, что Бегемот это придворный писарь Евдор и убивает его.
Айя знакомит Байека с Клеопатрой. Клеопатра рассказывает, что люди в масках это орден древних, и их очень много.
Клеопатра просит Байека убить 4 людей из ордена древних. Сначала он направляется в Летополис и решает убить Скарабея. От информатора Клеопатры он узнаёт где можно найти Тахарку (Скарабея) и убивает его.
Дальше он отправляется в Гизы, где убивает Халисет (Гиену).
Затем отправляется в Мемфис для того, чтобы убить Ящерицу. От жреца Пашеренптах Байек узнаёт, что жрец Хетепи это и есть Ящерица и убивает его.
Байек отправляется на арену Крокодилополиса, там побеждает двух гальских братьев. От них узнаёт, что Береника это Крокодил и убивает её.
Клеопатра решает выйти замуж за Цезаря. Цезарь помогает Байеку убить члена ордена древних - Потина (Скорпиона) и помогает найти Септимия (Шакала).
Во время сражения Цезарь мешает убить Септимия, тем самым предаёт Байека. После битвы, Айя с Байеком узнают, что Септимия вместе с Флавием (Львом) идут в храм, который находится в Сивах.
С помощью артефакта Септимия с Флавием из ордена древних открывают потайную комнату в храме, но им пытается помешать меджай Хепзефа и его убивают. Узнав о смерти друга, Байек отправляется по следам Флавия, а Айя едет в Рим за Септилием. Байек находит Флавия в Акрополе и убивает его. Тем временем Айя убивает Септимия и Цезаря. Байек и Айя отомстили за смерть сына и основали Братство Незримых.
Кинематографический трейлер:
Трейлер: "Рождение братства"
Трейлер игрового процесса: "Игра силы"
В отличие от других игр Assassin's Creed,вместо орлиного зрения у Байека появился орёл Сену. С помощью орла меджай узнаёт о целях.
Появились виды оружия (мечи,хопеши,копья,скипетры,двойные клинки,булавы,топоры)и категории (обычные,редкие,легендарные).
Карта мира,в отличие от других игр Assassin's Creed,очень большая.
Способности разделились на три направлея-инструменты,бой,лук.
В игре появились филаки. Они будут охотиться за Байеком по всему Египту. Но когда их убить,то можно получить легендарный костюм.
Костюм чёрный капюшон
Появилась панель управления анимуса.Она даёт выглядеть как хочеш и увеличивает силу.
Появился интерактивный тур, который рассказывает про историю Древнего Египта.
В DLC Assassin's Creed: Origins "Незримые" проходит год после основного сюжета. Байек отправляется в Синай, гле находятся "Незримые".Он встречается с Тахирой - основателем Сенайского братства и Гамилатом - вождём набатейских повстанцев.
Тахира рассказывает Байеку про римского полковдца, члена Ордена Древних - Руфио, который хотел прийти к власти. Для этого Руфио размещает на Синае трёх помощников (Птахмос, Ампелий, Тацит).
Байек решает сначала убить Тацита, который казнил рабов, работающих на каменаломне. Он находит его на каменаломне и убивает.
Следующий был й, которого Байек убивает на базе римлян.
Байек находит и убивает последнего помощника - Птахмоса.
После этого римляне узнают, где находится база Незримых и сжигают её. Берут в плен Тахиру, Кашту и Байека. Байеку помогает спастись Амунет(Айя).Байек помогает спастись Тахире и Каште. Тахира умирает от сильных ожогов. Байек узнаёт, что Руфио плывёт в Синай и на корабле его убивает.
Амунет рассказывает Байеку, как Гамилат нанимает повстанцев. В повстанцы идут люди, у которых убили родных и близких римляне. И Байек убивает Гамилата.
Появились 5 новых локаций: Фивы и 4 царства мёртвых; город Сенай; новое оружие; костюмы; транспорт. За Байеком начинают охотиться тени Скарабея и стражи царства мёртвых.
Амунет отправляет Байеку письмо,в котором сообщает,что в Фивах нашли реликвию. Он решает туда отправиться и плывёт на корабле. Когда он приплывает, он встречает Сутеха.
В это же время появляется тень фараона (Нефертити) и нападает на людей. Байек её побеждает.
Дальше Байек бежит к Мерти, знакомой Амунет.
Она рассказывает, что фараоны восстали, потому что кто-то украл реликвию. Мерти подсказывает Байеку, кто может подсказать про кражу реликвии. После расследования Байек встречается с Сутехом, который даёт амулет, чтобы оживить Нефертити. Байек идёт в царство мёртвых и оживляет Нефертити.
Байек побеждает Нефертити, возвращается в Фивы и продолжает расследование. Приходит к жрице Исидоре.
Баейк отправляется к Эхнотону в царство мёртвых и убивает его.
После расследования Байек идёт убивать Рамзеса II и осуществляет свой план.
Узнаёт, что Исидора и есть похитительница реликвии. Он находит её и пытается убить, но она отправляет к Тутанхамону.
Байек сначала убивает Тутанхамона, а затем Исидору. Реликвию отдаёт Сутеху на хранение.